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2018年最受欢迎的开放获取研究文章

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在2018年，Taylor＆Francis发表了10,000多篇新的开放获取研究论文。但其中哪些文章最能受到其他研究人员和广大公众的关注呢？我们详细分析了Taylor＆Francis 2018年的数据，为您揭示去年下载量最多的10篇开放获取文章。 1. LDL-C does not cause cardiovascular disease: a comprehensive review of the current literature LDL-C不会引起心血管疾病：对当前文献的全面回顾 作者：Uffe Ravnskov, Michel de Lorgeril, David M Diamond, Rokuro Hama, Tomohito Hamazaki, Björn Hammarskjöld, Niamh Hynes, Malcolm Kendrick, Peter H Langsjoen, Luca Mascitelli, Kilmer S McCully, Harumi Okuyama, Paul J Rosch, Tore Schersten, Sherif Sultan & Ralf Sundberg… 更多信息 >

口腔真菌是造成儿童龋齿的凶手吗？

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龋齿是最可预防的慢性疾病之一，其儿童患病率极高，尤其是在某些社会弱势群体中。在澳大利亚，55.7％的6-8岁儿童和63％的9岁儿童承受着这种慢性疾病的负担。预防和早期干预对龋齿的治疗至关重要，这有赖于对口腔中存在的微生物有更深入的了解。 细菌在龋齿发生和发展中的作用已得到充分认识，大量文献表明某些细菌是龋齿的主要病原体。最近的研究揭示了龋病的病因比以前认为的要复杂得多。遗传分析表明，龋齿不是由单一的细菌（变形链球菌）引起的，而是一种多微生物疾病，与口腔微生物组成的整体变化关系密切。口腔微生物组的定义是“在人口腔中或在其相邻延伸部分（例如在扁桃体和咽喉）的所有微生物”。然而，大多数对口腔微生物组的研究仅集中在细菌上，已知有超过700种细菌群存在于人类的口腔中。目前，相对细菌而言，很少有人知道真菌对口腔微生物的作用以及其对口腔健康及龋齿的影响。 口腔真菌群落以白色念珠菌为主，这种真菌已被证明可导致新生儿患上口咽鹅口疮，同时也是假牙佩戴者和免疫功能低下患者感染粘膜炎的罪魁祸首。因为在儿童早期龋齿中发现了大量的念珠菌，所以真菌被认为可能会造成龋齿。然而，尚不清楚这种关联是否直接。目前的文献表明，真菌可以参与生物膜的结构和功能，并可能导致龋齿的发生。真菌能够粘附在一系列表面上，产生多种分解代谢物，干扰宿主的免疫系统。白色念珠菌具有耐酸性和产酸性，其原因是真菌H+-ATPase具有高耐酸性和排出有机酸的能力，从而进一步降低pH值。白色念珠菌还具有分解蔗糖，葡萄糖和乳糖的能力。此外，念珠菌能够侵入牙本质小管，与变性胶原蛋白结合，分泌天冬氨酸蛋白酶，导致牙齿硬组织脱矿和溶解。与变形链球菌相比，它们具有更强的溶解羟基磷灰石的能力。对大鼠进行的研究表明，当动物接种白色念珠菌并喂食高蔗糖或葡萄糖饮食时，念珠菌可引起龋齿。通过研究口腔微生物中的真菌，可以深入了解真菌，特别是念珠菌在龋齿中的作用。 为了研究真菌对龋齿的影响，澳大利亚悉尼大学的学者使用高通量测序技术，首次将真菌作为的儿童口腔微生物的一部分进行研究。这份研究发表在Taylor & Francis出版集团的刊物Journal of Oral Microbiology上，该研究以17个有龋齿和无龋齿儿童为研究样本，评估了这些儿童的口腔菌群，结果表明，儿童口腔菌群中含有46种真菌。其中，白色念珠菌最丰富，不论是否龋齿，在所有样本中普遍存在，表明该菌种可能不会导致龋齿，这与迄今为止该领域的许多研究结果不同。虽然口腔健康的儿童与患有龋齿的儿童的整体真菌多样性相似，与龋齿状态无关，但研究发现龋齿影响了特定真菌的数量。与龋齿患儿有3种富集菌种相比，牙齿健康儿童的菌群丰富度显著更高，有17种之多。无龋齿和有龋齿各自的菌种丰富度有明显差别，虽然这些菌种可能是澳大利亚人口特有的，但该研究结果表明，真菌在口腔健康中发挥作用。 期刊介绍 Journal of Oral Microbiology 2017年影响因子：4.444         内容简介 Journal of Oral Microbiology是该领域第一个开放获取期刊，主要发布关于口腔感染的病理、毒性、寄生相互关系以及免疫学研究。期刊欢迎讨论口腔感染性疾病全球议程的研究，也欢迎提出新治疗策略和预防或改进现有策略的文章。

“盐过其食”的面包，如何降低它的“盐值”

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很多研究证实，饮食中钠摄入过量与高血压和心血管疾病等慢性疾病有密切联系。世界各地的人们每日的钠摄入量远超人体生理上所必需。在发达国家，人们平均每日盐摄入量在7.5到11.5克之间，远超过每日的推荐 用盐量（5~6克/日）。其他几个典型国家的人均每日盐摄入量分别为加拿大7.8克，法国8.4克，美国8.6克，英国9.5克，还有中国12克。与此类似，在所有的阿拉伯国家，钠摄入量均超过了低于2000毫克每日的推荐量。并且在这些国家，高血压是代谢性心脏病的主要危险因素。据报道，在黎巴嫩，高血压患病率呈上升趋势，达到了36.9％的惊人速度。 大多数研究证实了低盐饮食对降低高血压有积极作用，任何食物中盐含量的降低都可能对人们的健康产生积极影响并降低高血压患病率。在高收入和中等收入的社会中，因为盐被用于增加食品的风味和延长保质期，来自加工食品中的钠占人们钠摄入量的75％。高钠食物的消费频率是一个衡量钠摄入的参考指标，在许多社会中，面包是食用盐的主要来源之一。在黎巴嫩，加工食品占日平均盐摄入量的72％左右，其中25％来自面包类食品。皮塔饼面包，又称阿拉伯面包，几乎是黎巴嫩每餐必备的食品。食盐（NaCl）在面包制作中起到重要作用，它可以改善面包风味，控制酵母生长和发酵速度，改善面包质地并延缓面包的腐坏速度。降低面包的钠含量是一个巨大的挑战，因为大幅度降低钠含量可能会影响产品，尤其是味道。 研究者已提出一些方案，在降低钠含量的同时保持咸味，通常采用不含钠的其他矿物盐取代部分NaCl。KCl是面包中最常用的食盐替代品之一，它的主要缺点是高浓度使用时可导致口感不佳，产生令人讨厌的苦味和金属味。Ag-NaCl是另一种能够增加咸味的食盐替代物，据称它是一种能提供干净咸味的减盐成分。原则上，Ag-NaCl可以在不影响风味的前提下将许多产品的纳含量降低25~50%。 为了在保持面包的感官特性可接受的同时，减少来自面包的盐摄入量，黎巴嫩贝鲁特美国大学的学者进行了一项研究，这项研究成果发表Taylor & Francis旗下《International Journal of Food Properties》期刊上。在研究中，研究人员采用三种处理方法(NaCl、Ag-NaCl和NaCl-KCl)和控制五种不同盐含量制作出15种不同的皮塔饼面包。研究结果显示，盐含量的下降显著降低了面团的稳定性和断裂时间，提高了混合耐受性。采用Just-About-Right分析方法得出，面包中的最佳食盐含量为0.9%的NaCl。在不影响口味的情况下，需要0.67%的Ag-NaCl或1.13%的NaCl-KCl才能达到与0.9% NaCl相当的咸味，可以分别降低25.6%和12.1%的钠含量。研究结果表明，Ag-NaCl是一种有效的食盐替代品，具有防止面包风味丢失和降低钠含量的作用。因为大量的钾可能未必适合每一个人，研究建议不要用高含量的KCl代替NaCl。

Taylor & Francis出版集团推出全新的编辑资源网站（Editor Resources）

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Taylor ＆ Francis出版集团近日宣布推出全新的改版编辑资源（Editor Resources）网站。网站上汇集了各种关于出版领域的专业见解、信息和资源，以支持Taylor＆Francis的期刊编辑社区。 改版后的编辑资源网站内容围绕编辑工作的方方面面，用于组织和优化我们的资源。它结合了旧网站的最佳内容，为编辑提供了专门定制的新资源，以满足我们的编辑社区在其职业生涯的每个阶段的需求。 该网站的内容围绕六个核心主题进行策划：分别是内容开发、编辑委员会合作、出版道德、期刊可见性、同行评审和研究指标，这些都是期刊编辑工作的核心。 新版网站上的资源信息涵盖了不同的文章格式，包括案例研究、访谈、可下载的PDF指南和博客，所有这些内容都分别放在三个主题范围内，它们是： 欢迎来到Taylor ＆ Francis （Welcome to Taylor & Francis） 我们按照字母顺序A-Z列出了所有政策和指南，方便您查找。这其中涵盖了从作者信息到各种权限的所有内容。在此部分中，用户还可以找到与我们在线提交系统（ScholarOne Manuscripts和Editorial Manager）的操作方法视频以及有关Taylor ＆ Francis的更多信息。 编辑工作（The Editor’s Role） 通过丰富的资源来培养我们的编辑在六个关键领域的核心技能和理解，以支持他们的工作。通过可下载的PDF指南，可以获得六个热门主题和各种相关的信息，这一部分是编辑资源网站是支持我们编辑社区的必备工具包。 与您的社区建立联系（Meet your Community） 这部分有助于通过我们的全球活动项目将我们的编辑与社区联系起来。编辑还可以通过涵括在同行支持板块（Peer Support Zone）里的博客、访谈和案例研究从其他编辑那里学习到各种技巧和最佳实践，或者他们可以直接参与我们的“本周问题”系列讨论。

开放科学中心（COS）促进研究的开放性

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在Taylor＆Francis，我们相信研究需要更加开放。这是因为采用开放式的研究实践可以支持科研成果的透明度、可重复性和可复制性。这反过来又提高了研究的稳健性。 因此，我们颁布了一些开放的倡议来支持开放研究。其中包括我们的开放获取出版的选项以及数据共享政策。现在，我们很高兴地宣布，我们成为透明度开放促进（Transparency Openness Promotion，TOP）的签约方。TOP指南是一套8项指标，旨在提高研究的透明度和开放性。 我们采访了开放科学中心（Center for Open Science，COS）的政策倡议主任David Mellor，听取他对开放研究的见解，以及TOP指南如何帮助推动开放研究。 近年来，研究人员对研究开放性的态度有何变化？ 我们知道研究人员现在认识到大多数前沿研究中可信度的问题。有90％的科学家认为存在某种程度的“复制危机”。这是令人惊讶的，因为你经常看不到90％的科学家对此表示赞同！ 我花了大部分时间与许多不同层面的机构和学者合作，一起来提高研究的可复制性和透明度。这包括研究人员、作者、编辑、基金和出版商，但似乎很少有人质疑这些问题的存在。当大多数研究人员尝试并且未能复制之前研究的结果时，他们往往认为是自己的结果存在改进的空间。 文化变革具有挑战性，我们的战略也需要统一性。没有任何单一的期刊、出版商或研究人员勇于迈出第一步，因为这样做是有风险的。认识到我们可以改进这些现实状况是过去几年取得的巨大成功。 COS促进研究透明度和开放性的方式有哪些？ 在开放科学中心，我们的战略分成三个部分。 我们在心理学、社会学和临床癌症生物学方面进行大规模的复制研究。然后，我们可以确定哪些障碍会影响研究复制，并获得有关影响原始发现的意外因素的信息。 从这些项目中汲取的经验教训可以指导我们在政策上的制定，包括TOP指南、注册报告和开放科学徽章，以识别比普通研究更透明的学术研究。 我们构建并维护免费的开源开放科学框架（Open Science Framework，OSF）来支持研究人员的工作流程。该平台为研究人员提供了管理研究项目的协作空间。它包括注册表、数据存储库和预打印服务器。我们的政策建议及与研究人员合作直接预先注册或共享他们数据的经验，提供了可供使用的功能和工具。因此，这是影响科研文化以提高透明度的整体战略的重要组成部分。 为什么开放研究如此重要？ 科学的过程实际上取决于透明共享以及对潜在证据的评估。怀疑主义是科学界的核心价值，如果没有证据，我们不能辩证地评估证据。外面的世界也依赖于通过科学进程做出决策，所以科学界必须尽一切可能地做到可信，这是没有其他捷径可走的。虽然总体透明度依然存在障碍，但我们的任务是找出并克服这些障碍，而不是让他们成为我们的负担，阻碍我们的进步。 什么是TOP指南？ 透明度和开放促进（TOP）指南是一套改进科学报告的8项标准。他们通过提高基础研究数据和材料的清晰度来实现这一目标。期刊编辑、出版委员会、出版商和基金等决策者们希望实施更好的政策，但却同时面临着诸如社区支持、冲突标准或者没有时间起草新决策等障碍，我们希望TOP指南能成为他们的工具。每个TOP标准的存在都致力于解决那些试图复制先前研究结果的人所发现的特定问题。 数据、材料和分析代码透明度的标准都与研究过程中产生的项目以及如何保留或共享它们有关。设计和分析透明度标准指向特定于学科的报告指南，提醒作者报告关键的方法学细节。预注册标准强调了保持两种研究模式不同的重要性。其中之一是探索性研究，旨在寻找新的发现并找到新的趋势；另一个是验证性研究，其目的是检验一个特定的假设。很容易将两种研究模式混为一谈，并使用专为确认而设计的工具报告探索性测试的结果。最后，复制标准清楚地表明，直接复制是对科学的重要贡献，即使在传统上它们更难以被发表。 TOP标准中的每一条都可以在三个不断增加的严格程度中实施：披露、资格或授权的验证。这消除了实施某些标准的障碍，同时作为未来几年改进的路线图。 您认为开放研究最大的机会是什么？  我们认为注册报告的出版模式对科学改进的方式具有重大的潜在影响。该计划利用同行评审的优势，即专业内容的专家评估，并在结果公布之前将其重新导入研究过程。编辑和审稿人评估这些拟议的研究问题的重要性以及解决这些问题的拟议方法的能力。然后，他们可以“原则上”接受高质量的研究。无论研究结果如何，这都是对发布结果的承诺。即使存在无结果的可能性，也可以激励评论者和编辑思考如何确保研究人员以高标准进行研究，而不会错误地过分关注主要结果是否显着。 注册报告是解决论文发表偏倚的关键，并将注意力重新集中在重要事项上——研究问题的方法和重要性。作者喜欢这种形式，因为只要研究按照承诺进行，公认的研究就会发表。基金方也喜欢这种模式，因为他们知道无论结果如何，他们支助的工作都会被公布。 您认为研究人员使他们的研究开放和透明的最大挑战是什么？ 研究人员面临着发布、寻找资金和获得工作机会的压力。现在，我们经常使用有不完善的科学可信度指标做出这些决定。决定一项研究是否重要并且进展顺利是非常困难的，除了批判性评估和透明评估之外，没有捷径可走。但我们一直使用快捷方式。期刊影响因子是评估研究严谨性的最广为人知但却误用的指标。期刊水平评估与高影响因子期刊中任何个别研究的质量无关。克服它的唯一方法是更容易评估潜在的证据。这就是我们不断努力要让数据、材料或预注册的透明访问更容易展示的原因。透明度并不能保证工作本身很重要或质量很高，但它确实可以帮助他人作出判断。 开放科学徽章如何增强研究的开放性？ 徽章计划允许研究人员指出何时可以让其他人使用或验证基础内容。我们从这个计划中看到了几个好处：即使没有开放的数据要求，徽章也会与更高的数据共享率相关联，这可能很难实现。另一个有趣的关联是更高质量的数据共享。通常，作者可以声明数据是可用的，却没有实际将所有相关数据放入已识别的存储库中，而可能错误地认为数字或摘要就包含了“所有数据”。当作者在参照徽章标准时，编辑可以检查URL是否指向存储库，是否还有更多空间来提高实际提供数据的共享。而不仅仅是声明提供数据，这是一个重要的区别！ 最后，我们将徽章计划视为一种展示转向更透明研究实践的规范方式。也许你会忽视目前开放数据和预注册的趋势，直到你看到其他研究者每天都在做这样的提醒，并且正在接受对这些最佳实践的认可。

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